| Повишаване на националните способности за координация и реагиране при инциденти, свързани с киберсигурността | Министерство на електронното управление, чрез дирекция „Мрежова и информационна сигурност“ | 82 758 215 € | 78 620 304 € |
| Изпълнение на финансови инструменти по програма "Научни изследвания, иновации и дигитализация за интелигентна трансформация" 2021-2027 (ПНИИДИТ) | Фонд мениджър на финансови инструменти в България ЕАД | 60 033 613 € | 18 010 084 € |
| Биомедицински Технологичен център за изследвания (BioMedRTC): Среда за отлични научни постижения към иновационно ориентирана икономика в България | Институт по Молекулярна Биология "акад. Румен Цанев" | 30 000 000 € | 6 000 000 € |
| Въвеждане на иновативни технологии и развитие на капацитета на ДАНС за киберсигурност | Държавна агенция "Национална сигурност" | 24 539 774 € | 4 907 955 € |
| НАЦИОНАЛЕН ЦЕНТЪР ЗА ВЪРХОВИ ПОСТИЖЕНИЯ МЕХАТРОНИКА И ЧИСТИ ТЕХНОЛОГИИ | Сдружение Национален център за върхови постижения мехатроника и чисти технологии | 16 897 642 € | 4 513 367 € |
| Център за иновации в отбраната | София Тех Парк АД | 15 338 711 € | 0 € |
| Зелени иновации във водорода за устойчив енергиен преход - H2Start | Тракийски университет - Стара Загора | 14 994 599 € | 2 998 920 € |
| Създаване и устойчиво развитие на Център за компетентност "Агрохранителни системи и биоикономика" | Университет по хранителни технологии - Пловдив | 11 842 105 € | 2 492 473 € |
| Синьо иновативно и устойчиво управление на крайбрежната морска и речна околна среда и ресурси (Блу Кристал) | Институт по океанология | 11 815 423 € | 2 381 462 € |
| Финансиране на основни и допълнителни възнаграждения на служителите от УО и всички други съпътстващи ги разходи по ПНИИДИТ, съгласно националното законодателство и съществуващите добри практики. | Главна дирекция "Европейски фондове за конкурентоспособност" в министерство на иновациите и растежа, в качеството СИ на УО на пниидит | 10 481 520 € | 9 957 444 € |
| Център за върхови постижения Университети за наука, информатика и технологии в е-обществото (УНИТе) | Софийски университет "СВ.КЛИМЕНТ Охридски" | 8 570 476 € | 2 022 957 € |
| Повишаване на мрежовата и информационна сигурност (МИС) в инфраструктура на компетентни органи с цел защита на публичните услуги (CS 6) | Министерство на електронното управление, чрез дирекция "Мрежова и информационна сигурност" | 8 500 010 € | 1 700 002 € |
| Устойчиво развитие на Център за върхови постижения "Наследство БГ" | Софийски университет "Св. Климент Охридски" | 7 660 111 € | 1 944 765 € |
| Център за компетентност "Устойчиво оползотворяване на био-ресурси от лечебни и ароматични растения за иновативни продукти" | Институт по органична химия с център по ФИТОХИМИЯ-СОФИЯ | 7 432 165 € | 2 901 579 € |
| Големи данни за интелигентно общество (GATE) | Институт „Големи данни в полза на интелигентното общество“ | 7 333 065 € | 1 466 613 € |
| ЦЕНТЪР ЗА КОМПЕТЕНТНОСТ ПО ПЕРСОНАЛИЗИРАНА МЕДИЦИНА, 3D И ТЕЛЕМЕДИЦИНА, РОБОТИЗИРАНА И МИНИМАЛНО ИНВАЗИВНА ХИРУРГИЯ (ЦК "Леонардо да Винчи") | Медицински университет - плевен | 7 312 704 € | 3 332 982 € |
| Център за компетентност "Интелигентни мехатронни, еко- и енергооспестяващи системи и технологии" | Технически университет - Габрово | 7 218 367 € | 2 783 641 € |
| „Създаване на интегрирана иновативна инфраструктура за наука, технологии и предприемачество в Бургас - ИноБургас- Бъдещето започва от тук" | Община Бургас | 7 099 687 € | 0 € |
| Устойчиво развитие на Център по Растителна Системна Биология и Биотехнология (ЦРСББ) Пловдив | Център по растителна системна биология и биотехнология Сдружение | 7 085 454 € | 1 314 808 € |
| Център за компетентност „ПЕРИМЕД-2“ | Медицински университет - пловдив | 6 997 570 € | 1 714 425 € |